MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR02

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006970	GGGA	2	8	634	641	25 %	0 %	75 %	0 %	62718929
2	NC_006970	GC	3	6	655	660	0 %	0 %	50 %	50 %	62718929
3	NC_006970	C	6	6	660	665	0 %	0 %	0 %	100 %	62718929
4	NC_006970	GTG	2	6	702	707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62718929
5	NC_006970	G	6	6	718	723	0 %	0 %	100 %	0 %	62718929
6	NC_006970	GT	3	6	731	736	0 %	50 %	50 %	0 %	62718929
7	NC_006970	CGGT	4	16	743	758	0 %	25 %	50 %	25 %	62718929
8	NC_006970	CGC	2	6	769	774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718929
9	NC_006970	GCCT	2	8	877	884	0 %	25 %	25 %	50 %	62718929
10	NC_006970	CAC	2	6	886	891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62718929
11	NC_006970	CGC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718929
12	NC_006970	AC	3	6	989	994	50 %	0 %	0 %	50 %	62718929
13	NC_006970	CCAAT	2	10	1075	1084	40 %	20 %	0 %	40 %	62718929
14	NC_006970	ACC	2	6	1107	1112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62718929
15	NC_006970	CCT	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62718930
16	NC_006970	AAC	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62718930
17	NC_006970	GGC	2	6	1432	1437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62718930
18	NC_006970	CGC	2	6	1464	1469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718930
19	NC_006970	TCC	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62718930
20	NC_006970	CCG	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718930
21	NC_006970	ACAA	2	8	1665	1672	75 %	0 %	0 %	25 %	62718930
22	NC_006970	CCG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718930
23	NC_006970	GAGCTG	2	12	1701	1712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62718930
24	NC_006970	CGAGC	2	10	1734	1743	20 %	0 %	40 %	40 %	62718930
25	NC_006970	CGG	2	6	1765	1770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62718930
26	NC_006970	AAC	2	6	1771	1776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62718930
27	NC_006970	AC	4	8	1814	1821	50 %	0 %	0 %	50 %	62718930
28	NC_006970	AAC	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62718930
29	NC_006970	GGA	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62718930
30	NC_006970	CCA	2	6	1887	1892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62718930
31	NC_006970	AGCA	2	8	1915	1922	50 %	0 %	25 %	25 %	62718930
32	NC_006970	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62718930

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.